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Bueno, hasta donde sé, Windows continúa dominando el mercado.El S.O Windows fue por muchos años quien dominó el mercado de los sistemas operativos, al proponer una interfaz de usuario amigable e intuitiva para el usuario común (no experto en temas de informática y telecomuinicaciones). También vino acompañado de no pocos errores que se corregían de una versión a otra y con licencias de pago.
El núcleo de Linux lo desarrollaron antes de la aparición del Windows 95, más bien se hizo porque Linus Torvalds deseaba poder utilizar las capacidades multitarea de los procesadores de la época (Intel 80386) y MS DOS no lo hacía (y Tanembaum se negaba a permitir la modificación de Minix), aun si existió una versión multitarea de MS DOS, iba a salir como la versión 4 si mal no recuerdo, pero finalmente en Microsoft decidieron no sacarlo por motivos obvios y salió una versión 4 monotarea.El GNU/Linux surgió entonces como alternativa y competencia para Microsoft y para un sector más apegado al mudo de las máquinas computadoras.
El hecho de demandar más conocimientos de informatica en los usuarios va en oposición a la razón de ser de un sistema operativo, que existe en última instancia para facilitar las cosas, y mediante esa facilidad, reducir los costos de explotación del sistema informático.En mi experiencia GNU/Linux demanda de los usuarios más conocimientos de informática a diferentes niveles, por otra parte es de código abierto, con muchas herramientas gratuitas (aunque hay también distribuciones y herramientas de pago) y da muchas posibilidades de configuración, adaptación y seguridad. Te permite manipular el Kernel (para usuarios de mayor experiencia) y adaptar el sistema a tus necesidades y acogerte a una de las diversas distribuciones o distros (como sabores de un mismo helado). Los administradores de redes lo prefieren por cuestiones de seguridad. (también hay excelentes redes bien administradas sobre Windows Server).
Por lo demás, como dices, es buena la existencia de variadas opciones, la competencia engendra calidad, si GNU Linux no existiera tal vez Windows sería peor y viceversa; sólo no debemos ver esto como una cuestión de estatus, nadie es mejor que nadie por usar un sistema u otro (ni por saber un poco más o que los otros), cada sistema debe usarse en donde es más adecuado.